財政部高雄市國稅局表示：所得稅特有之扣繳制度，係稽徵機關為掌握課稅資料來源，並靈活國庫資金調度，是依法令規定，責負扣繳單位於給付所得時，依規定之扣繳率預先扣下所得人應繳納的所得稅，在規定時間內向國庫繳納並列單申報該管稽徵機關。惟該局每年進行例行扣繳檢查業務時，仍會發現扣繳義務人或因疏忽或不諳稅法規定，誤觸法令而遭補短漏扣繳稅款並處以罰鍰情事。
如該局近期查核時即發現，A公司於98年給付予非中華民國境內居住者乙君租金600,000元，因該公司一時不察，未按規定扣繳率20﹪扣取稅款120,000元，而誤依中華民國境內居住者之扣繳率10﹪，僅扣繳稅款60,000元，經該局查獲，除遭追繳短扣之稅款60,000元，並因違反所得稅法第114條第1款規定而被處以短扣稅款1.5倍罰鍰。
高雄市國稅局再次提醒，扣繳義務人應注意扣繳相關稽徵程序，以免遭補稅送罰，該局並說明相關稽徵程序如下：
（一） 所得人如為中華民國境內居住之個人，或在中華民國境內有固定營業場所之營利事業，扣繳義務人應於每月10日前將上1個月內所扣繳稅款向國庫繳清，並於次年1月底前將上1年內扣繳之稅款數額，開具扣繳憑單彙報該管稽徵機關查核，並於2月10日前將扣繳憑單填發納稅義務人。
（二） 所得人如為非中華民國境內居住之個人，或在中華民國境內無固定營業場所之營利事業，扣繳義務人應於代扣稅款之日起10日內，將所扣稅款向國庫繳清，並開具扣繳憑單向稽徵機關申報核驗。
至於給付屬應扣繳稅款之所得，因未達起扣點，及給付所得稅法第14條第1項第10類之其他所得，因不屬規定之扣繳範圍，而未經扣繳稅款者，扣繳單位應依同法第89條第3項規定，於每年1月底前向所轄主管稽徵機關列單申報，並於2月10日前將免扣繳憑單填發納稅義務人。
所稱「扣繳義務人」，依據所得稅法第89條規定，按扣繳單位之性質而有不同，概言之，機關團體之扣繳義務人為責應扣繳單位主管；一般事業單位為該事業負責人；執行業務者則為執行業務者本人。
